1.核心保护区 核心保护区主要包含福建武夷山国家级自然保护区的核心区、缓冲区、部分实验区,九曲溪上游保护带靠近自然保护区的部分区域,面积为505.76 km2,占总面积的50.50%。 2.一般控制区 一般控制区为国家公园内核心保护区以外的其他区域,主要包含福建武夷山国家级自然保护区的其余实验区,武夷山国家级风景名胜区及九曲溪上游保护带的其余区域,光泽武夷天池国家森林公园及周边公益林,邵武市国有林场龙湖场等区域,面积为495.65 km2,占总面积的49.50%。